Paper Highlights

Durch Polymerase-Kettenreaktion erzeugte DNA-Peptid-Netzwerke als künstliche extrazelluläre Matrix

Alexander Finke, Holger Bußkamp, Marilena Manea, Andreas Marx

Angew. Chem. Int. Ed. 2016, DOI:10.1002/ange.201604687

Ein DNA-Peptid-basiertes Netzwerk wurde mithilfe der Polymerase-Kettenreaktion erzeugt, auf dem Zelltypen selektiv gebunden, als auch anschließend wieder abgelöst werden können.

 

Crystal structure of a DNA catalyst

Almudena Ponce-Salvatierra, Katarzyna Wawrzyniak-Turek, Ulrich Steuerwald, Claudia Höbartner, Vladimir Pena

Nature 2016, DOI:10.1038/nature16471

Die erste dreidimensionale Struktur eines DNA-Enzyms (blau) gebunden an das Produkt der DNA-katalysierten Ligation zweier RNA Stücke (orange).

 

Spontane Bildung von RNA-Strängen, Peptidyl-RNA und Cofaktoren

Mario Jauker, Helmut Griesser, Clemens Richert

Angew. Chem. 2015, DOI:10.1002/ange.201506593

Aminosäuren und Ribonucleotide reagieren unter Kondensationsbedingungen zu Peptidyl-RNA.

 

A biocatalytic cascade for versatile one-pot modification of mRNA starting from methionine analogues

Fabian Muttach, Andrea Rentmeister

Angew. Chem. Int. Ed. 2015, DOI:10.1002/anie.201507577

Enzymatische Herstellung von AdoMet-Analoga aus Methionin-Analoga und direkte Übertragung auf RNAs mit 5‘-Kappe

 

The reverse transcription signature of N-1-methyladenosine in RNA-Seq is sequence dependent

Ralf Hauenschild, Lyudmil Tserovski, Katharina Schmid, Kathrin Thüring, Marie-Luise Winz, Sunny Sharma, Karl-Dieter Entian, Ludivine Wacheul, Denis L. J. Lafontaine, James Anderson, Juan Alfonzo, Andreas Hildebrandt, Andres Jäschke, Yuri Motorin, Mark Helm

Nucleic Acids Res. 2015, DOI:10.1093/nar/gkv895

Bei der reversen Transkription hinterlässt 1-Methyladenosin Spuren in der cDNA

 

Extraordinary thermal stability of an oligodeoxynucleotide octamer constructed from alternating 7-deaza-7-iodo guanine and 5-iodocytosine base pairs – DNA duplex stabilization by halogen bonds?

Natalya Ramzaeva, Henning Eickmeier, Helmut Rosemeyer

Chem. Biodiversity 2014, DOI:10.1002/cbdv.201300300

A reinvestigation of the published X-ray crystal-structure analyses of 7-halogenated (Br, I) 8-aza-7-deaza-2’-deoxyguanosines Br7c7z8Gd; 1a and I7c7z8Gd, 1b, as well as of the structurally related 7-deaza-7-iodo-2’-deoxy-ß-D-ribofuranosyladenine (ß-I7c7Ad; 2-6e in Table 1) and its α-D-anomer (α -I7c7Ad; 3) clearly revealed the existence of halogen bonds between corresponding halogen substituents and the adjacent N(3)-atoms of neighboring nucleoside molecules within the single crystals. These halogen bonds can be rationalized by the presence of a region of positive electrostatic potential, the σ-hole, on the outermost portion the halogen’s surface, while the three unshared pairs of electrons produce a belt of negative electrostatic potential around the central part of the halogen substituent. The N(3) atoms of the halogenated nucleosides carry a partial negative charge. This novel type of bonding between nucleosides was tentatively used to explain the extraordinary high stability of oligodeoxynucleotides constructed from halogenated nucleotide building blocks.